МКСС 2019 | T8: Персей V — Сети | Шивани Тивари

Сетевой анализ включает в себя разнообразные инструменты для анализа омиксных данных. Протеомные данные PTM дают ключевое представление о клеточной сигнализации, но, как известно, сложны для анализа. Однако в контексте сети физических белок-белковых взаимодействий возможен функциональный анализ данных PTM, и результаты естественным образом интерпретируются как сигнальные сети. Сети коэкспрессии отражают нефизические взаимодействия между белками и основаны на общих количественных профилях. В клинической протеомике такие сети можно кластеризовать и коррелировать с измеренными фенотипами. В этом руководстве мы рассмотрим анализ сетей коэкспрессии, фосфопротеомики и белок-белковых взаимодействий в Perseus.