Создание прямых и обратных праймеров для начинающих
Nikolay's Genetics Lessons
0:00 / 0:00
Создание прямых и обратных праймеров для начинающих
46 468 просмотров · 3 года назад
Nikolay's Genetics Lessons
57,8 тыс. подписчиков
46 468 просмотров · 3 года назад
Праймеры — ключевые компоненты синтеза ДНК, процесса, который происходит в лаборатории при секвенировании, клонировании, ПЦР и других методах молекулярной биологии.
С помощью Benchling команды могут легко получать доступ к общим библиотекам праймеров, загружать новые последовательности праймеров или разрабатывать совершенно новые праймеры. Информация о праймерах напрямую связывается с блокнотом Benchling и реестром Benchling, обеспечивая полную отслеживаемость каждого эксперимента, в котором использовался праймер. Вы можете легко сопоставлять результаты экспериментов с точным набором использованных праймеров или видеть, с какими последовательностями связан тот или иной праймер. После разработки праймеров можно проводить ПЦР in silico или использовать их для планирования важных задач, таких как рестрикционное клонирование, сборка Golden Gate и клонирование Gibson.
Что такое праймеры?
Праймеры — это простые, но ключевые компоненты синтеза ДНК как в нашем организме, так и в научных экспериментах. Праймеры также называют олигонуклеотидами; это буквально небольшие фрагменты одноцепочечных нуклеотидов, обычно длиной от 5 до 22 пар оснований. Главное свойство праймеров — их комплементарность к матричной ДНК, что позволяет им «подготавливать» нить для связывания с ДНК-полимеразой и инициирования синтеза ДНК.
Какие типы праймеров существуют? РНК-праймеры против ДНК-праймеров
Живые организмы используют исключительно РНК-праймеры, в то время как в лаборатории обычно используются ДНК-праймеры. Ученые используют ДНК-праймеры вместо РНК-праймеров по ряду причин. ДНК-праймеры гораздо более стабильны, их легче хранить, и для инициирования синтеза им требуется меньше труднодоступных ферментов.
Задача:
Разработайте 5-нуклеотидные праймеры для копирования выделенного фрагмента.
5 ́ ACGACCGATAGACGACGTAGGACTTACTTACTTACGTAGGCA 3 ́
3 ́ TGCTGGCTATCTGCTGCATCCTGAATGAATGAATGCATCCGT 5 ́
\