Структуры данных Xarray в биологии: примеры и лучшие практики — Иэн Хант-Айзак | SciPy 2026
SciPy
0:00 / 0:00
Структуры данных Xarray в биологии: примеры и лучшие практики — Иэн Хант-Айзак | SciPy 2026
227 просмотров · 2 недели назад
SciPy
2,51 тыс. подписчиков
227 просмотров · 2 недели назад
За последний год [Xarray](https://xarray.dev/blog/xarray-biology) получил широкое распространение в различных областях биологии, что выявило интересные проблемы. Определить наилучший способ представления структуры данных (например, anndata, NGFF-Zarr) в виде объекта Xarray может быть непросто. Кроме того, некоторые варианты использования, такие как визуализация всего головного мозга, требуют применения менее известных функций Xarray, таких как пользовательские индексы.
В этом докладе я продемонстрирую примеры кодирования распространенных биологических структур данных в виде объектов Xarray. Наконец, я покажу, как инфраструктура пользовательских индексов расширила возможности полезного кодирования данных в Xarray.