Геномика, визуализация и ИИ — Юэн Бирни

10 января 2023 г. — Национальный институт исследований генома человека (NHGRI) проводит семинар «Геномика, визуализация и ИИ — три технологии, которые меняют биологические исследования и клиническую практику». За последние два десятилетия три основные технологии стали основой нашего понимания живых систем: геномика, включая молекулярно-биологические методы анализа на основе нуклеиновых кислот; визуализация от разрешения, близкого к атомному, до структур целых организмов; и машинное обучение, включая большие и нелинейные архитектуры искусственного интеллекта (ИИ). Доктор Эван Бирни кратко расскажет о развитии этих технологий, используя примеры из Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL), и затронет как фундаментальные биологические открытия, так и клинические применения. В заключение он представит перспективы развития этих технологий, их впечатляющие возможности, ландшафт данных и навыки, необходимые для их реализации, а также некоторые потенциальные ловушки, которых следует избегать. Подробности мероприятия: https://www.genome.gov/event/genomics... Разделы: 0:00 - Введение (Эрик Грин) 4:35 - Вступительное слово (Эван Бирни) 5:39 - О Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) 6:55 - Актуальные задачи в биологических науках 7:49 - Понимание биологии: тот же подход с 1960-х годов! 9:29 - Последовательные технологические инновации 13:09 - Направления совершенствования 16:25 - Что это позволило? 18:43 - Научные услуги: Визуализация в разных масштабах 21:38 - Три примера новых методов визуализации 25:15 - ИИ / Машинное обучение 27:09 - Глубокое обучение 28:41 - Ключевые элементы ИИ 30:37 - «Маркировка» в глубоком обучении 35:06 - AlphaFold: ускорение научных открытий в области сворачивания белков 38:49 - Глубокое обучение с использованием альтернативной математической инфраструктуры 41:38 - Открытые, организованные фундаментальные биомолекулярные данные 43:21 - Ресурсы данных в EMBL-EBI 44:13 - Глобальная коалиция биоданных 45:13 - Вторичное использование геномики и визуализации в здравоохранении 46:45 - Вычислительные среды: оборудование (GPU) с оптимизированным доступом к данным 48:14 - Глобальный альянс по геномике и здравоохранению (GA4GH) 48:55 - GA4GH в глобальном обучении в здравоохранении Система 49:17 - Развитие кадрового потенциала 53:35 - Пример 1: фундаментальные исследования; Ядерная пора 54:46 - Пример 2: Клинические операции 58:47 - Примеры существенных изменений в результатах 1:00:49 - Вопросы и ответы