Исследование микробиома фасоли обыкновенной

Доклад представлен на: Виртуальном мероприятии по микробиологии и иммунологии 2019 Докладчик: Нейц Стопнисек, доктор философии — научный сотрудник, Мичиганский государственный университет Биография докладчика: Нейц Стопнисек — научный сотрудник кафедры микробиологии и молекулярной генетики Мичиганского государственного университета. Его исследования посвящены использованию секвенирования нового поколения, метаболомики, биоинформатики и физиологических методов для характеристики микробных сообществ, связанных с почвой и растениями, выявления их функциональной значимости и расшифровки молекулярных и метаболических механизмов, лежащих в основе их реакции на антропогенные воздействия и процессы изменения климата. В последнее время его работа сосредоточена на изучении полезных микроорганизмов фасоли обыкновенной и их интеграции в стратегии селекции растений. До прихода в Мичиганский государственный университет доктор Стопнисек работал научным сотрудником в Вашингтонском университете, применяя подходы синтетической микробной экологии для лучшего понимания синтрофных взаимодействий в анаэробных системах. Он имеет степень доктора философии Цюрихского университета (Швейцария) и диплом бакалавра Люблянского университета (Словения). Вебинар: Исследование микробиома фасоли обыкновенной Аннотация вебинара: Растения привлекают почвенные микробы, которые обеспечивают питательные вещества, способствуют росту и защищают от патогенов. Однако полный потенциал микробных сообществ для поддержания здоровья растений и сельского хозяйства не реализован, отчасти потому, что трудно определить приоритетность ключевых для здоровья растений представителей ризосферы. Микробы, повсеместно ассоциированные с определенным видом растений в больших пространственных масштабах и при различных почвенных условиях, представляют собой практическую отправную точку для обнаружения полезных представителей. В данном исследовании мы количественно оценили структуру бактериальных/архейных и грибных сообществ в ризосфере фасоли обыкновенной (Phaseolus vulgaris) и определили ее основной состав у двух эволюционно различных генотипов, выращенных в полевых условиях в пяти основных регионах выращивания в Соединенных Штатах. Мы обнаружили консервативный основной микробиом, состоящий из 271 бактериального, архейного и грибного таксона, которые постоянно ассоциировались с фасолью обыкновенной, несмотря на различия в типах почв, методах выращивания, климате и генотипах. Нейтральные модели взаимосвязи численности и распространения, а также сети совместного встречаемости предполагают, что эти основные таксоны находятся в тесной связи с растением, а не являются важными членами местного почвенного микробиома. Мы расширили наше исследование, используя образцы ризосферы, включающие восемь дополнительных генотипов фасоли обыкновенной, выращенных на колумбийских почвах. Удивительно, но было обнаружено 48 устойчивых бактериальных таксонов во всех образцах, включая фасоль, выращенную в США и Колумбии. Многие из основных таксонов были еще не культивированы и относились к протеобактериям; эти таксоны являются основными объектами функциональных исследований в поддержку устойчивого развития сельского хозяйства, в частности, выращивания фасоли обыкновенной. В более общем плане, наш подход позволяет получить представление о микробных таксонах, которые могут быть приоритетными для трансляционных исследований в области управления микробиомом растений. Цели обучения: 1. Ризосфера — одна из самых разнообразных экосистем, содержащая большое количество полезных для растений микроорганизмов и выполняющая множество функций. 2. Растения постоянно привлекают ряд экологически важных микробных таксонов, которые представляют собой основной микробиом. Представители основного микробиома потенциально могут быть использованы в стратегиях селекции растений. Получите баллы PACE: 1. Убедитесь, что вы зарегистрированный пользователь LabRoots (https://www.labroots.com/) 2. Посмотрите вебинар на YouTube или на веб-сайте LabRoots (https://www.labroots.com/virtual-even...) 3. Нажмите здесь, чтобы получить баллы PACE (срок действия – 12 сентября 2021 г., 09:00): https://www.labroots.com/credit/pace-... LabRoots в социальных сетях: Facebook:   / labrootsinc   Twitter:   / labroots   LinkedIn:   / labroots   Instagram:   / labrootsinc   Pinterest:   / labroots   SnapChat: labroots_inc