Лекция 14 CompBio MIT — GWAS (часть 1)
Manolis Kellis
0:00 / 0:00
Лекция 14 CompBio MIT — GWAS (часть 1)
2 374 просмотра · 7 лет назад
Manolis Kellis
25,4 тыс. подписчиков
2 374 просмотра · 7 лет назад
Вычислительная биология MIT: геномы, сети, эволюция, здоровье
Профессор Манолис Келлис
http://compbio.mit.edu/6.047/
Осень 2018
Лекция 14 - Полногеномные ассоциативные исследования
1. Введение в генетику: Мендель, человеческие признаки, сцепление
Менделевские признаки: сцепление, генетические карты, семейные исследования
Сложные признаки: полигенность, окружающая среда, непрерывные
2. Полногеномные ассоциативные исследования (GWAS)
Дизайн исследования: контроль качества, критерий хи-квадрат, множественное тестирование, репликация, QQ
Точное картирование, сцепление против ассоциации, комбинированные исследования
3. Интерпретация: отдельные локусы против глобальных сигналов
Локусы: механизм, анализы, аллельные, пациенты, мыши, клетки
Системы: сети, смещения, статистика, PPI, экспрессия, диагностика
4. Следующее поколение: экзом, геном, медицинское секвенирование
Распространенные, Низкочастотные, редкие, частные, соматические; диагностика
Аутизм: полигенный, носители; случай/контроль, трио; de novo
Слайды к лекции 14:
https://stellar.mit.edu/S/course/6/fa...