From Concept to Code: Building a Molecular Docking App
PharmAInformatics и Pharmacology Concepts By Rajesh Choudhary
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From Concept to Code: Building a Molecular Docking App
149 просмотров · 1 день назад
PharmAInformatics и Pharmacology Concepts By Rajesh Choudhary
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build a Molecular Docking app using Python and AutoDock Vina in this demonstration video. If you are looking to streamline your computational biology workflow or automate virtual screening for drug discovery, this guide provides the complete blueprint for your own custom software tool.
Building a custom platform for drug discovery requires integrating complex bioinformatics libraries with standardized simulation engines. This tutorial walks you through setting up the environment, parsing PDB files, and executing AutoDock Vina scripts to predict ligand-protein binding affinities efficiently. By the end of this project, you will have a functional Python application capable of handling high-throughput docking tasks with minimal manual intervention.
Chapters
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Subjects: Basics of Python Programming for Pharmaceutical Sciences
Python in pharmacy (BP101T): • Basics of Python for Pharmaceutical Scienc...
Shorts: • Python Pharmacy Shorts
Pharmacologyconcepts Channel: / pharmacologyconceptsbyrajeshchoudhary
Website: https://pharmacyconcepts.in/
data analysis: • Data Analysis
Drug DIscovery: • Drug Discovery and in silico Pharmacology
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Python का उपयोग करके अपना खुद का molecular docking ऐप बनाना सीखें। यह ट्यूटोरियल फार्मा छात्रों के लिए एक व्यावहारिक मार्गदर्शिका है।
Python programming का उपयोग करके एक मॉलिक्यूलर डॉकिंग वर्कफ़्लो तैयार करना अब आसान है। यह सामग्री उन छात्रों के लिए है जो drug discovery के क्षेत्र में कोडिंग का उपयोग करना चाहते हैं।
हम प्रोटीन और लिगैंड के बीच के protein-ligand interaction को समझने और उनके परिणामों को सारणीबद्ध करने की प्रक्रिया को विस्तार से कवर करेंगे। आप यह भी देखेंगे कि कैसे डेटा को विज़ुअलाइज़ किया जाता है ताकि निष्कर्ष निकालना आसान हो जाए।
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0:00 Introduction to Molecular Docking Python workflow
1:41 build Molecular Docking app by Streamlit
2:46 Process for molecular Docking
5:25 Live Molecular Docking
8:05 Results analysis of Docked complex
#moleculardocking #pythonprogramming #autodockvina #drugdiscovery #bioinformatics