Разработка синтетических энхансеров с учетом типа клеток для тестирования функций генов

В этом выпуске Discover ASAP Сеппе Де Винтер, магистр наук, Никлас Кемпинк, магистр наук, Дэвид Модуит, доктор философии, и Ибрагим Таскиран, доктор философии, члены команды Voet из Collaborative Research Network (CRN), присоединяются к Девину Снайдеру, доктору философии, старшему программному сотруднику Aligning Science Across Parkinson’s (ASAP), чтобы обсудить CREsted. Эта модель глубокого обучения может быть использована для эффективного проектирования синтетических, специфичных для типов клеток энхансеров, позволяющих тестировать функцию генов в контексте. Ознакомиться с публикацией можно здесь: https://www.nature.com/articles/s4158... Получить пакет Python для глубокого обучения можно здесь: https://github.com/aertslab/CREsted 0:44 - Усилители и преимущества разработки синтетических версий 3:46 - Создание усилителей, специфичных для типов клеток 6:10 - Тестирование усилителей 7:30 - Использование усилителей для различных типов моделей 8:25 - Использование CREsted для разработки усилителей Проект Discover ASAP призван способствовать распространению знаний и повышению равенства в научном сообществе путем продвижения прозрачных исследовательских практик и предоставления возможности другим воспроизводить результаты работы. Мы рады поделиться этими интервью и видео с исследовательским сообществом в надежде, что они помогут ускорить открытия в области #болезнипаркинсона. Оставайтесь на связи! 🔗 Веб-сайт: https://parkinsonsroadmap.org/# LinkedIn:   / asap-research   Bluesky: https://bsky.app/profile/asapresearch... Это видео продолжает обсуждение из предыдущего видео, посвященного EndoMAP, интерактивному инструменту визуализации данных для изучения структурного интерактома эндолизосомальной системы. Посмотрите видео:    • EndoMAP: Visualizing the Endosomal Structu...