Анализ дифференциальной экспрессии генов в R с DESeq2

Анализ дифференциальной экспрессии генов в R с DESeq2 Title: Differential Gene Expression Analysis in R with DESeq2 | Bioinformatics for Beginners | Анализ дифференциальной экспрессии генов в R с DESeq2 Description: Добро пожаловать в наш подробный учебник по анализу дифференциальной экспрессии генов с использованием R и DESeq2 для данных RNA-seq! В этом видео мы проведем вас через весь процесс — от предварительной обработки данных до продвинутых методов визуализации. 🔍 Вы узнаете: 1️⃣ Импорт и предварительная обработка данных: Загрузите данные RNA-seq в R и выполните базовую обработку для подготовки данных к анализу. 2️⃣ MA-график: Создайте MA-графики для визуализации распределения значений экспрессии генов и выявления дифференциально экспрессируемых генов. 3️⃣ Диаграмма дисперсии: Оцените изменчивость экспрессии генов между образцами, чтобы гарантировать надежность анализа. 4️⃣ Анализ главных компонент (PCA): Снизьте размерность данных, выявите скрытые закономерности, определите выбросы и кластеры. 5️⃣ Вулкан-график (Volcano Plot): Визуализируйте значимые дифференциально экспрессируемые гены, контролируя ложноположительные результаты. 6️⃣ Тепловая карта (Heatmap): Визуализируйте шаблоны экспрессии генов по образцам и кластерам для анализа ко-экспрессии и функционального обогащения. Hashtags (Russian + English): #mrbioinformatix #bioinformatics #DESeq2 #анализ_экспрессии_генов #differentialgeneexpressionanalysis #normalization #rna #ncbi #genomics #bioinformaticsforbeginners #tutorial #howto #omics #research #ngs #geneexpression #dna #dnasequencing Ссылки: DESeq2 Vignette: http://bioconductor.org/packages/deve... Подписывайтесь: TikTok:   / mrbioinformatix   Instagram:   / mr.bioinformatix_