Перейти к содержимому

Один метод для разработки ВСЕХ праймеров | Общие, SBE, SSR, SNP, q- и RT-ПЦР, мультиплексные и дл...

Roshan Ali Academy

0:00 / 0:00

Один метод для разработки ВСЕХ праймеров | Общие, SBE, SSR, SNP, q- и RT-ПЦР, мультиплексные и дл...

4 006 просмотров · 4 месяца назад
Roshan Ali Academy
14,2 тыс. подписчиков
4 006 просмотров · 4 месяца назад
Узнайте, как разработать ЛЮБОЙ тип ПЦР-праймера всего за 20 минут, используя один мощный метод с помощью Primer3 на Python! В этом полном руководстве по биоинформатике я пошагово демонстрирую разработку праймеров практически для всех основных применений, включая: ✅ Общие ПЦР-праймеры ✅ Праймеры для qPCR ✅ Праймеры для RT-PCR ✅ Праймеры для мультиплексной ПЦР ✅ Праймеры для секвенирования ✅ Праймеры для клонирования ✅ Праймеры для обнаружения SNP ✅ Фланкирующие праймеры для SSR ✅ Праймеры для SBE ✅ Вырожденные праймеры ✅ Длинные ПЦР-праймеры ✅ И многое другое... Временные метки 00:00 Введение 00:53 Шаг первый; Загрузка необходимых инструментов 03:33 Шаг второй; Установка Primer3 05:14 Шаг третий; Импорт Primer3 05:25 Шаг четвертый; Получение шаблонной последовательности 06:23 Шаг пятый; Очистка последовательности 06:59 Шаг шестой; Сохранение последовательности в переменной 07:55 Шаг седьмой; Определение целевого региона (экзон, интрон, SSR, SNP, ген, ORF и т. д.) 08:54 Шаг восьмой; Создание аргументов последовательности (идентификатор последовательности, имя и целевой регион) 10:32 Шаг девятый; Создание глобальных аргументов (температура плавления праймера, длина, GC, размер ампликона) 10:20 Шаг десятый; Разработка праймеров 13:09 Шаг одиннадцатый; Получение результата (прямые и обратные праймеры) 13:35 Практическое руководство 17:00 Вывод 17:09 Как изменить последовательность и глобальные аргументы для разных типов праймеров 19:52 Как разработать зонд 20:04 Праймеры для обнаружения/фланкирования SSR/фланкирования SNP 20:15 Праймеры SBE 20:38 Таблица всех аргументов последовательности 20:52 Таблица глобальных аргументов 21:05 Запросить подписку Этот урок специально разработан для: 🔬 Студентов молекулярной биологии 🧬 Исследователей в области генетики 💻 Изучающих биоинформатику 🎓 Аспирантов (MPhil/PhD) 🧪 Исследователей в области ПЦР и геномики В этом видео вы узнаете: ✔ Установку и использование Primer3 в Python ✔ Универсальную стратегию для разработки праймеров ✔ Важные параметры праймеров Объяснение ✔ Содержание GC, температура плавления (Tm), длина праймера, шпильки, димеры, специфичность и многое другое ✔ Как быстро и эффективно разрабатывать праймеры для различных экспериментов Независимо от того, являетесь ли вы начинающим или опытным исследователем, это руководство поможет вам освоить разработку праймеров с помощью простого рабочего процесса. 📌 Используемое программное обеспечение: Primer3 Python 📌 Ключевые слова: Учебник по разработке праймеров, Учебник по Primer3, Разработка ПЦР-праймеров, Разработка qPCR-праймеров, Разработка RT-PCR-праймеров, Учебник по биоинформатике, Разработка SNP-праймеров, Разработка SSR-праймеров, Праймеры для секвенирования, Праймеры для клонирования, Мультиплексная ПЦР, Вырожденные праймеры, Биоинформатика на Python #PrimerDesign #Primer3 #Bioinformatics #PCR #qPCR #RTPCR #Python #MolecularBiology #Genetics #MultiplexPCR #Sequencing #Cloning #SNP #SSR