Один метод для разработки ВСЕХ праймеров | Общие, SBE, SSR, SNP, q- и RT-ПЦР, мультиплексные и дл...
Roshan Ali Academy
0:00 / 0:00
Один метод для разработки ВСЕХ праймеров | Общие, SBE, SSR, SNP, q- и RT-ПЦР, мультиплексные и дл...
4 006 просмотров · 4 месяца назад
Roshan Ali Academy
14,2 тыс. подписчиков
4 006 просмотров · 4 месяца назад
Узнайте, как разработать ЛЮБОЙ тип ПЦР-праймера всего за 20 минут, используя один мощный метод с помощью Primer3 на Python! В этом полном руководстве по биоинформатике я пошагово демонстрирую разработку праймеров практически для всех основных применений, включая:
✅ Общие ПЦР-праймеры
✅ Праймеры для qPCR
✅ Праймеры для RT-PCR
✅ Праймеры для мультиплексной ПЦР
✅ Праймеры для секвенирования
✅ Праймеры для клонирования
✅ Праймеры для обнаружения SNP
✅ Фланкирующие праймеры для SSR
✅ Праймеры для SBE
✅ Вырожденные праймеры
✅ Длинные ПЦР-праймеры
✅ И многое другое...
Временные метки
00:00 Введение
00:53 Шаг первый; Загрузка необходимых инструментов
03:33 Шаг второй; Установка Primer3
05:14 Шаг третий; Импорт Primer3
05:25 Шаг четвертый; Получение шаблонной последовательности
06:23 Шаг пятый; Очистка последовательности
06:59 Шаг шестой; Сохранение последовательности в переменной
07:55 Шаг седьмой; Определение целевого региона (экзон, интрон, SSR, SNP, ген, ORF и т. д.)
08:54 Шаг восьмой; Создание аргументов последовательности (идентификатор последовательности, имя и целевой регион)
10:32 Шаг девятый; Создание глобальных аргументов (температура плавления праймера, длина, GC, размер ампликона)
10:20 Шаг десятый; Разработка праймеров
13:09 Шаг одиннадцатый; Получение результата (прямые и обратные праймеры)
13:35 Практическое руководство
17:00 Вывод
17:09 Как изменить последовательность и глобальные аргументы для разных типов праймеров
19:52 Как разработать зонд
20:04 Праймеры для обнаружения/фланкирования SSR/фланкирования SNP
20:15 Праймеры SBE
20:38 Таблица всех аргументов последовательности
20:52 Таблица глобальных аргументов
21:05 Запросить подписку
Этот урок специально разработан для:
🔬 Студентов молекулярной биологии
🧬 Исследователей в области генетики
💻 Изучающих биоинформатику
🎓 Аспирантов (MPhil/PhD)
🧪 Исследователей в области ПЦР и геномики
В этом видео вы узнаете:
✔ Установку и использование Primer3 в Python
✔ Универсальную стратегию для разработки праймеров
✔ Важные параметры праймеров Объяснение
✔ Содержание GC, температура плавления (Tm), длина праймера, шпильки, димеры, специфичность и многое другое
✔ Как быстро и эффективно разрабатывать праймеры для различных экспериментов
Независимо от того, являетесь ли вы начинающим или опытным исследователем, это руководство поможет вам освоить разработку праймеров с помощью простого рабочего процесса.
📌 Используемое программное обеспечение:
Primer3
Python
📌 Ключевые слова:
Учебник по разработке праймеров, Учебник по Primer3, Разработка ПЦР-праймеров, Разработка qPCR-праймеров, Разработка RT-PCR-праймеров, Учебник по биоинформатике, Разработка SNP-праймеров, Разработка SSR-праймеров, Праймеры для секвенирования, Праймеры для клонирования, Мультиплексная ПЦР, Вырожденные праймеры, Биоинформатика на Python
#PrimerDesign #Primer3 #Bioinformatics #PCR #qPCR #RTPCR #Python #MolecularBiology #Genetics #MultiplexPCR #Sequencing #Cloning #SNP #SSR