Молекулярный докинг на Mac с использованием Chimera и AutoDock Vina | PyMOL | Лиганд-белковый док...
Dr. H Ismail
0:00 / 0:00
Молекулярный докинг на Mac с использованием Chimera и AutoDock Vina | PyMOL | Лиганд-белковый док...
2 555 просмотров · 4 мес. назад
Dr. H Ismail
5,49 тыс. подписчиков
2 555 просмотров · 4 мес. назад
🧬 Узнайте, как выполнить молекулярный докинг белка и лиганда на macOS с помощью Chimera, PyMOL и AutoDock Vina.
В этом подробном пошаговом руководстве мы подготовим структуру белка, подготовим лиганд, определим сетку докинга, запустим AutoDock Vina и визуализируем результаты докинга с помощью PyMOL и UCSF Chimera.
📌 Рассматриваемые темы
✔ Подготовка белка в Chimera
✔ Подготовка лиганда
✔ Удаление молекул воды и гетероатомов
✔ Добавление атомов водорода и зарядов
✔ Генерация файлов PDBQT
✔ Настройка AutoDock Vina
✔ Запуск молекулярного докинга на macOS
✔ Визуализация положений докинга в PyMOL
✔ Анализ взаимодействий связывания
💻 Используемое программное обеспечение
• UCSF Chimera
• PyMOL
• AutoDock Vina
• macOS
🎯 Подходит для:
• Вычислительная химия
• Разработка лекарств
• Молекулярное моделирование
• Биоинформатика
• Структурная биология
• Фармацевтические исследования
📢 Подпишитесь на канал, чтобы получать больше уроков по:
• Молекулярный докинг
• GROMACS
• Avogadro
• Discovery Studio
• AmberTools
• Моделирование молекулярной динамики
Канал:
/ @coach.ismail
#MolecularDocking #AutoDockVina #PyMOL #Chimera #MacOS #ComputationalChemistry #DrugDiscovery #Bioinformatics #Coachismail