Перейти к содержимому

Молекулярный докинг на Mac с использованием Chimera и AutoDock Vina | PyMOL | Лиганд-белковый док...

Dr. H Ismail

0:00 / 0:00

Молекулярный докинг на Mac с использованием Chimera и AutoDock Vina | PyMOL | Лиганд-белковый док...

2 555 просмотров · 4 мес. назад
Dr. H Ismail
5,49 тыс. подписчиков
2 555 просмотров · 4 мес. назад
🧬 Узнайте, как выполнить молекулярный докинг белка и лиганда на macOS с помощью Chimera, PyMOL и AutoDock Vina. В этом подробном пошаговом руководстве мы подготовим структуру белка, подготовим лиганд, определим сетку докинга, запустим AutoDock Vina и визуализируем результаты докинга с помощью PyMOL и UCSF Chimera. 📌 Рассматриваемые темы ✔ Подготовка белка в Chimera ✔ Подготовка лиганда ✔ Удаление молекул воды и гетероатомов ✔ Добавление атомов водорода и зарядов ✔ Генерация файлов PDBQT ✔ Настройка AutoDock Vina ✔ Запуск молекулярного докинга на macOS ✔ Визуализация положений докинга в PyMOL ✔ Анализ взаимодействий связывания 💻 Используемое программное обеспечение • UCSF Chimera • PyMOL • AutoDock Vina • macOS 🎯 Подходит для: • Вычислительная химия • Разработка лекарств • Молекулярное моделирование • Биоинформатика • Структурная биология • Фармацевтические исследования 📢 Подпишитесь на канал, чтобы получать больше уроков по: • Молекулярный докинг • GROMACS • Avogadro • Discovery Studio • AmberTools • Моделирование молекулярной динамики Канал:    / @coach.ismail   #MolecularDocking #AutoDockVina #PyMOL #Chimera #MacOS #ComputationalChemistry #DrugDiscovery #Bioinformatics #Coachismail