Cas12 и Cas13 в редактировании генома: за пределами CRISPR-Cas9

Ссылки/Ресурсы:   / the_crux   Все видео по генной инженерии:    • Genetic Engineering (Genes to Genomes)   В этом видео подробно обсуждаются ферменты Cas9, Cas12, Cas13, Cas12f и Cas3. В основном, мы обсуждаем альтернативные ферменты Cas, используемые в редактировании генов и геномной инженерии. Наше обсуждение начинается с классической системы SpCas9 и рассматривает ее варианты, требования к PAM, внецелевые эффекты, а также сравнивает различные модифицированные высокоточные варианты Cas9, включая HyperAccurate Cas9, xCas9 и SpRY-Cas9 без PAM. Мы также сравниваем встречающиеся в природе ортологи Cas9, такие как SaCas9, SauriCas9 и PsCas9, подчеркивая различия в размере, специфичности и свойствах расщепления ДНК. В семействе Cas12 мы обсуждаем Cas12a/Cpf1, Cas12b, Cas12e/CasX и CasY, а также то, как их богатые тимином PAM-последовательности, расщепление, опосредованное RuvC, и разрезание ДНК на «липкие» концы полезны для нацеливания на богатые АТ-последовательностями геномные регионы и 3'-нетранслируемые области. В отличие от них, ферменты Cas13 нацелены на одноцепочечную РНК, а не на ДНК. Они имеют компактную gRNA, как правило, требуют наличия фланкирующих последовательностей протоспейсера (PFS) и демонстрируют явление коллатерального расщепления РНК. Наконец, мы обсуждаем ферменты Cas12f и Cas3. Cas12f — это компактная нуклеаза, способная расщеплять одноцепочечную ДНК и вызывать коллатеральное повреждение ДНК. Система Cascade-Cas3 представляет собой процессивный комплекс CRISPR, разрушающий ДНК, с геликазной и АТФазной активностью, способный разрывать ДНК на большие расстояния. Видео завершается обзором других недавних достижений в области инженерии CRISPR, включая варианты Cas12, нацеленные на РНК под управлением ДНК, и независимую от PAM систему TIGR-Tas, разработанную группой Фэна Чжана в Массачусетском технологическом институте. 00:00 Повестка дня 00:44 SpCas9 и варианты 03:28 Ферменты Cas12 05:10 Ферменты Cas13 06:33 Коллатеральное расщепление 07:11 Фермент Cas12f 07:47 Каскад Cas3 08:35 Система TIGR-Tas CRISPR-Cas9 в редактировании генома:    • Genome Editing with CRISPR-Cas9   Ссылки/Ресурсы:   / the_crux   Плейлисты, которые обязательно нужно посмотреть Все видео по генной инженерии:    • Genetic Engineering (Genes to Genomes)   Все видео по репликации ДНК:    • All about DNA Replication!   Все видео по транскрипции:    • All about Transcription!   Все видео по переводу:    • All about Translation!   Поддержите развитие этого канала, став патроном:   / the_crux   Я ценю вашу поддержку :)