Визуализация соматических мутаций с помощью maftools: онкоплоты, TMB и сигнатуры мутаций.

В этом уроке вы узнаете, как преобразовать список соматических мутаций в готовые к публикации визуализации и биологические данные — используя maftools и MutationalPatterns в R. Это часть 4 серии «Полногеномное/экзомное секвенирование для абсолютных новичков». ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ ⏱️ ВРЕМЕННЫЕ МЕТКИ ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 0:00 Введение 0:53 Семинар по RNA-seq 2:41 Обзор анализа мутаций 4:10 Настройка среды 6:04 Подготовка файлов MAF (преобразование VCF в MAF) 7:56 Создание Oncoplots 10:03 Ген-специфические диаграммы «леденец на палочке» 11:59 Анализ мутаций на уровне образцов (мутационная нагрузка опухоли) 13:53 Анализ мутаций на уровне генов 15:16 Анализ транзиций/трансверсий (Ti/Tv) 17:56 Анализ мутационных сигнатур (APOBEC) 21:00 Анализ горячих точек мутаций 22:34 Анализ белковых доменов 23:55 Сравнение образцов и кластеризация (соматические взаимодействия) ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 📖 ПИСЬМЕННО Учебное пособие ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ Полное руководство с кодом: https://ngs101.com/how-to-analyze-who... ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 🎓 Секвенирование РНК в режиме реального времени МАСТЕР-КЛАСС — РАННЯЯ РЕГИСТРАЦИЯ ЗАВЕРШАЕТСЯ 11 АПРЕЛЯ ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ Если вы работаете с данными RNA-seq (или знаете, что вам это понадобится), я провожу 7-сессионный онлайн-мастер-класс, разработанный специально для абсолютных новичков. Предварительный опыт работы с командной строкой или программирования не требуется. ✅ 7 онлайн-сессий с практическим программированием с первого дня ✅ Предварительно настроенная облачная среда — локальная настройка не требуется ✅ От основ Linux до полного, готового к публикации конвейера ✅ Пожизненная доступность записей + 1 месяц поддержки по электронной почте ✅ Всего 15 мест · Начало 5 мая 2026 г. 🔥 Ранняя регистрация: 797$ (обычная цена: 997$) — Ранняя регистрация заканчивается 11 апреля 👥 Групповая скидка для 3 и более участников из одного учреждения 👉 Подробнее и регистрация: https://ngs101.com/workshop/rna-seq-w... #WGS #CancerGenomics #Bioinformatics #maftools #SomaticMutations #MutationAnalysis #NGS #WholeGenomeSequencing #Oncology #Genomics #Bioconductor #RStats #МутационныеСигнатуры #МутационнаяНагрузкаОпухолей #Онкограф