Семинар IGM: д-р Джишну Дас, PhD — 14 мая 2026 г.

Изучение иммуномодуляции с использованием интерпретируемых методов машинного обучения и сетевых подходов Доктор Джишну Дас из Университета Питтсбурга Аннотация: Наша лаборатория интегрирует многомасштабные, многомодальные наборы данных, используя интерпретируемые методы машинного обучения и сетевые подходы, которые выходят за рамки биомаркеров и позволяют делать выводы о возможных механизмах иммуномодуляции. Метод обнаружения и исследования значимых латентных факторов взаимодействия (SLIDE) — это первый в своем классе интерпретируемый метод машинного обучения, который был применен к широкому спектру инфекционных, аутоиммунных и аллоиммунных заболеваний для получения соответствующих механистических данных. Мы разработали SpaceTravLR, новую структуру для развития пространственной биологии на уровне отдельных клеток — от описательного картирования до причинно-следственного моделирования — путем выявления пространственных функциональных микрониш, лежащих в основе ряда иммунных фенотипов. Я также опишу грамматику взаимодействия скользящего окна (SWING), новую языковую модель взаимодействия для количественной оценки влияния генетических вариаций на взаимодействия белков и пептидов. В заключение я расскажу о методах выявления регуляторных и сигнальных цепей, лежащих в основе принятия решений о судьбе клетки. Посетите наш веб-сайт, чтобы узнать больше о будущих семинарах! https://igm.ucsd.edu