Перейти к содержимому

Как использовать GNPS за 10 минут | Пошаговое руководство по молекулярной сети

Zakat Science

0:00 / 0:00

Как использовать GNPS за 10 минут | Пошаговое руководство по молекулярной сети

1 339 просмотров · 6 месяцев назад
Zakat Science
75 подписчиков
1 339 просмотров · 6 месяцев назад
Узнайте, как выполнить **анализ молекулярных сетей в GNPS всего за 10 минут**! В этом пошаговом руководстве я покажу вам, как загрузить файл MGF из MZmine, запустить рабочий процесс анализа молекулярных сетей в GNPS, понять этапы обработки и загрузить файл GraphML для визуализации в Cytoscape. Если вы уже подготовили данные в MZmine и экспортировали файл MGF, это видео проведет вас через весь рабочий процесс GNPS — от отправки задания до загрузки результатов анализа молекулярных сетей. 🔬 В этом видео вы узнаете: • Как создать учетную запись GNPS и войти в нее • Как загрузить файлы спектров MGF • Как отправить задание на создание молекулярной сети • Что делает GNPS во время кластеризации спектров и сопоставления библиотек • Как интерпретировать страницу результатов GNPS • Где скачать файлы GraphML для Cytoscape • Как подготовить данные для визуализации сети Этот урок идеально подходит для: ✔ Исследователей в области метаболомики ✔ Пользователей LC-MS / MS/MS ✔ Ученых, занимающихся природными соединениями ✔ Аспирантов и студентов ✔ Всех, кто использует MZmine + GNPS для создания молекулярных сетей на основе признаков (FBMN) К концу этого видео вы успешно создадите свою молекулярную сеть и загрузите файл GraphML, готовый для визуализации в Cytoscape. В следующем видео мы откроем файл GraphML в Cytoscape и создадим визуализацию молекулярной сети, готовую к публикации. Ключевые слова: Учебное пособие по GNPS, молекулярные сети GNPS, молекулярные сети на основе признаков, рабочий процесс FBMN, загрузка MGF в GNPS, анализ данных LC-MS, сети MS/MS, загрузка Cytoscape GraphML, молекулярные сети метаболомики #GNPS #МолекулярныеСети #FBMN #Метаболомика #LCMS #Масс-спектрометрия #Cytoscape #MZmine