REDCapSync и RosyREDCap
R Consortium
0:00 / 0:00
REDCapSync и RosyREDCap
176 просмотров · 4 месяца назад
R Consortium
23 тыс. подписчиков
176 просмотров · 4 месяца назад
Демонстрация R/Medicine 2026
Полное название: REDCapSync и RosyREDCap: Расширенный API REDCap для пользователей R, даже начинающих; Стандартизированные конвейеры обработки данных и сопутствующее приложение Shiny для любого проекта REDCap
R и REDCap широко используются в медицине, включая фундаментальные исследования, клинические исследования и клинические испытания. Оба инструмента обладают независимыми преимуществами, но вместе они могут создавать мощные конвейеры обработки данных. Существует несколько пакетов R для их использования, однако REDCapSync — это первый пакет R для REDCap, который обеспечивает «полную» обработку данных, эффективно использует API и не зависит от проекта. RosyREDCap — это сопутствующее приложение Shiny для разведочного анализа данных.
Используя кэш последнего сохранения проекта, файловый каталог и журнал REDCap, REDCapSync обновляет только те данные, которые были изменены с момента последнего вызова API. Каждый проект поддерживается как стандартизированный объект R6, который можно использовать в дальнейшем для получения всех преимуществ R! Кроме того, REDCapSync можно использовать для загрузки размеченных данных через API, функция, недоступная на веб-сайте REDCap.
RosyREDCap — это приложение R Shiny, которое запускает локальный веб-сайт для разведочного анализа данных проектов REDCap. Оно создано для загрузки всех предыдущих проектов, настроенных с помощью пакета REDCapSync. Пользователь может переключаться между проектами, обезличивать данные, выполнять визуализацию данных по запросу и многое другое.
Использование таких инструментов, как REDCapSync и RosyREDCap, позволяет даже начинающим пользователям R использовать возможности API REDCap без необходимости изучения десятков конечных точек API. В ходе своей презентации я продемонстрирую объединенные преимущества R и REDCap для поддержания надежных воспроизводимых конвейеров обработки клинических данных, которые могут улучшить клинические исследования и уход за пациентами.
Ресурсы
R/Medicine: https://rconsortium.github.io/RMedici...
R Consortium: https://www.r-consortium.org/