Как выполнить секвенирование BigDye? #Учебник
Erkaya Mustafa
0:00 / 0:00
Как выполнить секвенирование BigDye? #Учебник
1 748 просмотров · 3 года назад
Erkaya Mustafa
735 подписчиков
1 748 просмотров · 3 года назад
Секвенирование с использованием красителей (Big-Dye Sequencing) — это необходимый этап, на котором к очищенным ДНК-продуктам добавляют краситель. Эти красители связываются с нуклеотидами, поэтому секвенатор может распознавать последовательности, считывая окрашенные нуклеотиды.
Перед использованием секвенатора необходим еще один этап. На этом этапе удаляются излишки красителей, оставшиеся после секвенирования с использованием красителей. Вот видеоинструкция по этому протоколу: • How to Perform a Pre-Sequencing Bead Clean...
Следующий протокол:
1) Мастер-микс следует приготовить дважды: один раз с прямым праймером и один раз с обратным праймером, используя следующий рецепт для каждого образца:
6,00 мкл стерильной воды
2,25 мкл 5-кратного буфера для секвенирования Big Dye
0,25 мкл Big Dye Terminator V3.1 (это количество можно изменить в зависимости от длины последовательности. Например, 0,375 мкл — предпочтительное количество для MediumSeq, а 0,5 мкл — предпочтительное количество для LongSeq.)
0,50 мкл прямого/обратного праймера (эти праймеры использовались в ПЦР)
2) Приготовьте мастер-микс и добавьте ~9 мкл раствора мастер-микса в каждую пробирку с соответствующей маркировкой.
3) Добавьте 1 мкл продукта Post Exo-AP в пробирки с соответствующими этикетками.
4) Центрифугируйте пробирки.
5) Отнесите образцы в термоциклер и следуйте протоколу, показанному в видео.
6) Храните продукты Post Big-Dye при температуре 4 градуса Цельсия.
Если у вас возникнут вопросы, оставьте комментарий.