C. Borgogna - Перераспределение IFI16 в цитоплазму контролирует репликацию РНК-вируса.

Чинция Боргонья, доцент кафедры микробиологии Университета Пьемонта Ориентале, факультет трансляционной медицины, Новара (ИТАЛИЯ), выступает с докладом на тему «Перемещение IFI16 в цитоплазму контролирует репликацию РНК-вируса». Аннотация Интерферон-гамма-индуцируемый белок 16 (IFI16) наиболее известен как ядерный ДНК-сенсор, активирующий сигналы врожденного иммунитета, но он также оказывает прямое противовирусное действие во время инфекции РНК-вирусами. В нашем исследовании мы наблюдали, что инфекция человеческими коронавирусами индуцирует перемещение IFI16 в цитоплазму, позиционируя его в местах репликации вируса. Во время инфекции SARS-CoV-2 цитоплазматический IFI16 связывается с вирусной РНК и белком нуклеокапсида (N) и ограничивает репликацию, нарушая жидкостно-жидкостное фазовое разделение, обусловленное N–РНК, необходимое для эффективной репликации и сборки. Как показали исследования, потеря IFI16 усиливает репликацию вируса и способствует раннему образованию крупных перинуклеарных N-богатых конденсатов, что подтверждает модель, в которой IFI16 ограничивает образование компартментов репликации/сборки вируса. Когда мы распространили эти наблюдения на другие коронавирусы человека, истощение IFI16 усиливает репликацию OC43, но снижает репликацию NL63, указывая на то, что, хотя цитоплазматическая релокализация сохраняется, функциональный результат является вирус-специфическим. Помимо коронавирусов, мы также наблюдали, что инфекция различными РНК-вирусами (включая флавивирусы и рабдовирусы) способствует накоплению IFI16 в цитоплазме, что предполагает более широкую противовирусную программу. Поскольку инфекция РНК-вирусами и стресс, вызванный двухцепочечной РНК, индуцируют образование стрессовых гранул, мы исследовали, способствует ли IFI16 этому пути. Структурное предсказание и анализ поверхностного плазмонного резонанса выявили прямое взаимодействие между IFI16 и нуклеатором стрессовых гранул G3BP1, что было дополнительно подтверждено в клетках, инфицированных SARS-CoV-2, с помощью анализа проксимальной лигации, демонстрирующего их цитоплазматическую ассоциацию на ранних стадиях инфекции. Используя поли(I:C) в качестве суррогата вирусной двухцепочечной РНК, клетки с дефицитом IFI16 демонстрировали большее количество и больший размер G3BP1-положительных стрессовых гранул по сравнению с клетками с нормальным уровнем IFI16. Этот фенотип был связан с усиленной колокализацией PKR с двухцепочечной РНК, что согласуется с повышенной чувствительностью к двухцепочечной РНК и активацией PKR в отсутствие IFI16. В целом, наши результаты идентифицируют цитоплазматический IFI16 как многофункциональный регулятор репликации РНК-вирусов благодаря его влиянию на РНК-конденсаты и динамику стрессовых гранул.