Курс по языку макросов ImageJ/Fiji [NEUBIASAcademy@Home]
NEUBIAS
0:00 / 0:00
Курс по языку макросов ImageJ/Fiji [NEUBIASAcademy@Home]
30 235 просмотров · 6 лет назад
NEUBIAS
3,58 тыс. подписчиков
30 235 просмотров · 6 лет назад
Язык макросов ImageJ — это простой в освоении скриптовый язык, встроенный в ImageJ/Fiji. В этом видео показано, как использовать его для автоматизации рабочих процессов обработки/анализа изображений.
Материалы:
https://github.com/ahklemm
Пожалуйста, задавайте вопросы, связанные с материалом, на:
https://forum.image.sc/t/neubias-acad...
Содержание:
0:03:57 Рабочий процесс получения контура ядерной мембраны и его измерения.
0:10:24 Макрорекордер и пакетная обработка в ImageJ
0:22:35 Переменные - Теория
0:37:22 Встроенные макрофункции
0:45:04 Запрос пользовательского ввода
0:51:04 Циклы for
1:07:17 Пакетная обработка
1:09:02 Массивы - Теория
1:20:27 Операторы if
1:25:51 Передовая практика
1:28:10 Что делать дальше
Автор: Анна Клемм, Центр биоинформатики изображений, SciLifeLab, Швеция
Проведен в интерактивном формате 14-15 апреля 2020 года в NEUBIAS Academy совместно с Кристианом Тишером (EMBL Heidelberg), Фабрисом Кордельером (BIC, Университет Бордо), Офрой Голани (Институт Вейцмана, Реховот), Роменом Гуйет (EPFL, Лозанна), Брэм ван ден Брук (NKI, Амстердам), Эльназ Фазели (Университет Турку) и Рокко д’Антуоно (Институт Фрэнсиса Крика, Лондон).