Перейти к содержимому

Docking Molecular con AUTODOCK VINA (2026): GUIA COMPLETA paso a paso + Instalación GRATIS Windows

re-Computing Science

0:00 / 0:00

Docking Molecular con AUTODOCK VINA (2026): GUIA COMPLETA paso a paso + Instalación GRATIS Windows

1 785 просмотров · 3 месяца назад
re-Computing Science
1,36 тыс. подписчиков
1 785 просмотров · 3 месяца назад
🔗 Enlaces: Descarga la Guía completa de Introducción a AutoDock Vina: https://recomputing-science.com/landi... Descarga AutoDock Vina y Vina Split: https://github.com/ccsb-scripps/AutoD... Descarga AutoDock Tools: https://ccsb.scripps.edu/mgltools/dow... Descarga PyMOL: https://www.pymol.org/ Más contenido sobre biocomputación en ➡️ https://recomputing-science.com Aprende a instalar AutoDock Vina GRATIS en Windows y lanzar tu primer cálculo de docking paso a paso. El docking molecular es una de las herramientas de bioinformática estructural más utilizadas para predecir cómo se une un ligando a un receptor objetivo. En este video, realizaremos un experimento completo de re-docking con AutoDock Vina para validar nuestro protocolo computacional, utilizando como modelo la proteasa del VIH y su inhibidor cristalizado con el PDB ID: 1HSG. 🔍 ¿Qué aprenderás en este tutorial?: Descarga, instalación y uso de AutoDock Tools y AutoDock Vina Limpieza inicial de estructuras en PyMOL: Aprende a aislar el ligando y el receptor eliminando moléculas de disolvente, etc. Preparación en AutoDock Tools (ADT): Añadiremos hidrógenos, cargas, configuraremos los enlaces rotables del ligando, el Grid Box con las dimensiones y coordenadas tridimensionales, generaremos los archivos en formato PDBQT... Ejecución del con Vina desde la terminal. Análisis de Resultados: veremos brevemente cómo interpretar los resultados del log de Vina, usaremos vina_split y calcularemos y realizaremos el análisis visual en PyMOL 💡 No olvides suscribirte al canal para más tutoriales de bioquímica, biofísica y biocomputación 😉​ 📲 Puedes encontrarnos en Instagram: instagram.com/recompsci/ 00:30 Introducción al Docking Molecular y AutoDock Vina 02:52 Descarga de Vina y Vina Split 04:32 Descarga e instalación de AutoDock Tools 08:33 Preparación del receptor y ligando en PyMOL 14:54 Preparación del ligando en ADT 21:00 Preparación de la proteína en ADT 23:35 Definición de la caja de búsqueda y el Binding Site 30:56 Generación del archivo de configuración 33:29 Ejecución del Docking 36:28 Análisis del log y resultados 39:12 Visualización en PyMOL 41:52 Guardar el log del cálculo 44:12 Conclusiones y recomendaciones Music: Rainy Afternoon by Snoozy Beats Free Download: https://www.youtube.com/redirect?even... Music promoted by Audio Library:    • Calm Chillhop Beat for Reading and Focus 📚...   Music: Blissful Morning by Snoozy Beats https://www.youtube.com/redirect?even... Free Download / Stream: https://www.youtube.com/redirect?even... Music provided by Audio Library chimes by Snoozy Beats Free Download: https://www.youtube.com/redirect?even... Music provided by Audio Library Just Lucky — Land of Fire [Audio Library Release] Music provided by Audio Library Plus Watch:    • Just Lucky — Land of Fire | Free Backgroun...   Free Download: https://www.youtube.com/redirect?even... Different Story VIP — Another Kid [Audio Library Release] Music provided by Audio Library Plus Watch:    • Different Story VIP — Another Kid | Free B...   Free Download: https://www.youtube.com/redirect?even...