Анализ РНК-секвенирования (Часть 2) | Установка, контроль качества, выравнивание, количественный ...
Bioinformatics With BB
0:00 / 0:00
Анализ РНК-секвенирования (Часть 2) | Установка, контроль качества, выравнивание, количественный ...
683 просмотра · 6 мес. назад
Bioinformatics With BB
27,8 тыс. подписчиков
683 просмотра · 6 мес. назад
В этом видео мы продолжаем рабочий процесс анализа РНК-секвенирования и переходим от практической настройки к реальной обработке данных. Эта часть охватывает установку, загрузку общедоступных наборов данных, проверку качества FASTQ, обрезку, подготовку референса, выравнивание и количественную оценку на уровне генов.
Это не просто пошаговое руководство по рабочему процессу. Оно также включает в себя устранение неполадок в реальном времени, демонстрируя, как проблемы, связанные с инструментом, могут возникать в реальной вычислительной биологии и как мы можем адаптировать конвейер, используя альтернативный подход, не останавливая анализ.
Темы, рассматриваемые в этом видео:
Краткий обзор рабочего процесса РНК-секвенирования
Общедоступные репозитории РНК-секвенирования
Установка инструмента и настройка терминала
Контроль качества FASTQ с помощью FastQC
Обрезка прочтений с помощью Cutadapt
Подготовка референсного генома
Рабочий процесс выравнивания
Количественная оценка на уровне генов с помощью FeatureCounts
Устранение неполадок в реальном времени при анализе РНК-секвенирования
Это видео предназначено для студентов, исследователей и начинающих специалистов в области биоинформатики, которые хотят понять, как на практике выполняется анализ РНК-секвенирования.
Найдите команды и материалы: https://bioinformaticsbb.online/tutor...
#биоинформатика #наука #ролики #искусственный интеллект #геномика #РНК #РНКсеквенирование