Анализ данных RNA-Seq (Часть 3) | Нормализация, визуализация и интерпретация DESeq2

В этом видео мы продолжаем рабочий процесс RNA-seq и переходим к этапу последующего анализа, используя матрицу подсчета, сгенерированную на предыдущих этапах. Эта часть охватывает: Настройка DESeq2 и установка пакета Чтение таблицы подсчета FeatureCounts Фильтрация генов с низким количеством подсчетов Нормализация данных RNA-seq Сводная статистика Исследовательский анализ данных Графики распределения экспрессии Тепловые карты Ранжированные и кумулятивные графики экспрессии Интерпретация нормализованных результатов RNA-seq Это видео призвано помочь начинающим понять, как данные RNA-seq преобразуются в интерпретируемые биологические результаты. Пока что оно не фокусируется на дифференциальной экспрессии между несколькими группами. Вместо этого цель состоит в том, чтобы заложить прочную основу в нормализации и исследовательском транскриптомном анализе. В следующем видео мы перейдем к сравнению образцов и непосредственно рассмотрим результаты сравнения. Если вы находите подобные образовательные видео полезными, пожалуйста, поддержите их. Подготовка этих обучающих материалов требует много времени, поиска и устранения неисправностей и усилий, а цель — поделиться знаниями на практике. #RNASeq #DESeq2 #Биоинформатика #Транскриптомика #ЭкспрессияГенов #NGS #ВычислительнаяБиология #Геномика #Биокондукто #наука #геномика #образование #исследования #экспрессияГенов #биоинформатика #биология #геномика #секвенированиеДНК #РНК