Сегментация и написание скриптов с помощью Fiji/ImageJ

Сегментация и создание скриптов с помощью Fiji/ImageJ | Кертис Руден | 29 октября, виртуальная конференция I2K 2024 Авторы: Кертис Руден, Центр количественной клеточной визуализации, Университет Висконсина-Мэдисон; Эдвард Эванс, Центр количественной клеточной визуализации, Университет Висконсина-Мэдисон Описание: Этот семинар посвящен методам анализа изображений с использованием Fiji/ImageJ. Вы научитесь выполнять классическую сегментацию изображений шаг за шагом, создавать скрипт для автоматизации процесса, обеспечивающий воспроизводимость на любом количестве изображений, и который послужит отправной точкой для будущей настройки и расширения рабочих процессов анализа. Инструкции перед семинаром: Загрузите и распакуйте Fiji с сайта https://fiji.sc/#download, запустите его, затем выполните команду *Help to Update...*, чтобы убедиться, что Fiji полностью обновлен. Для запуска Fiji на macOS может потребоваться перетащить распакованный файл Fiji.app в папку «Приложения» и/или обойти Gatekeeper, как описано по адресу https://support.apple.com/guide/mac-h.... Ключевые слова: fiji, imagej, сегментация, воспроизводимость, автоматизация, обработка изображений, анализ изображений