Учебное пособие по AutoDock Vina: молекулярный докинг для начинающих

В этом руководстве мы предлагаем подробное пошаговое описание использования AutoDock Vina, мощного программного инструмента для молекулярного докинга и виртуального скрининга в разработке лекарств. Независимо от того, являетесь ли вы новичком или опытным исследователем, это видео проведет вас через весь процесс прогнозирования способов связывания лиганда с рецептором и аффинности с помощью AutoDock Vina. Файл config.txt необходимо создать вручную для определения параметров докинга. Вот как это сделать: Откройте текстовый редактор и добавьте следующие строки (при необходимости отрегулируйте): receptor = receptor.pdbqt ligand = ligand.pdbqt center_x = [X-координата] center_y = [Y-координата] center_z = [Z-координата] size_x = [Размер по оси X] size_y = [Размер по оси Y] size_z = [Размер по оси Z] out = output.pdbqt exhaustiveness = 8 Настройте для более тщательной стыковки (по умолчанию 8) Замените имена файлов и координаты в соответствии с вашим рецептором/лигандом и сайтом связывания. Сохраните файл как config.txt в той же директории, что и файлы стыковки. Скачать инструменты MGLTools https://ccsb.scripps.edu/mgltools/dow... AutoDock Vina https://vina.scripps.edu/downloads/ UCSF Chimera https://www.cgl.ucsf.edu/chimera/down... #МолекулярныйДоккинг #ОткрытиеЛекарств #УчебникПоAutoDockVina #ВиртуальныйСкрининг #Доккинг #ВычислительнаяБиология #дляНачинающих #биоинформатика #молекулярныйДоккинг #начинающий #дляначинающих