ADS1: считывает данные в формате FASTQ
Ben Langmead
0:00 / 0:00
ADS1: считывает данные в формате FASTQ
36 062 просмотра · 11 лет назад
Ben Langmead
18,9 тыс. подписчиков
36 062 просмотра · 11 лет назад
Мы обсуждаем, как риды кодируются в файлах FASTQ. Мы также обсуждаем качество оснований и что оно означает. Страница курса: https://www.coursera.org/course/ads1.
── Ссылки на курс и канал ──
Плейлист курса: Алгоритмы секвенирования ДНК
• Algorithms for DNA Sequencing
── Об авторе ──
Бен Лэнгмид — профессор компьютерных наук в Университете Джона Хопкинса, где его исследования охватывают биоинформатику, вычислительную биологию и науку, основанную на больших данных. Он является автором Bowtie и Bowtie 2; его группа также разработала программное обеспечение, такое как Kraken 2, и ресурсы, такие как recount3 и Index Zone, а также методы индексирования и запросов пангенома, основанные, например, на r-индекс и структура перемещения. Методы его группы цитировались более 130 000 раз, и он является лауреатом таких наград, как премия NSF CAREER, стипендия Слоуна для научных исследований, премия Бенджамина Франклина за вклад в открытый доступ, а также многочисленных наград за преподавание и наставничество. Бен является основателем и руководителем InOrder Labs LLC (https://inorderlabs.com), экспертной консалтинговой фирмы в области биоинформатики и вычислительной биологии.
Канал: / @benlangmead
Учебные материалы: https://langmead-lab.org/teaching.html