RFdiffusion3: простое руководство по созданию каркасов на основе мотивов

В видеоролике показано, как каталитический структурный мотив, извлеченный из структуры белка, может быть сохранен при одновременном создании совершенно нового окружающего каркаса. Письменные руководства: Начинающий: https://rosettacommons.github.io/foun... Средний уровень (дополнение к этому видео): https://rosettacommons.github.io/foun... Начиная с кристаллической структуры 1MG5, руководство рассматривает четыре ключевых этапа: 1. Извлечение каталитического мотива из структуры белка 2. Преобразование структурных ограничений в конфигурацию RFdiffusion3 3. Запуск генерации каркаса на основе диффузии из командной строки 4. Оценка сгенерированных структур для проверки сохранения мотива Руководство предназначено для начинающих и студентов, имеющих базовые знания о структурах белков и работе с командной строкой. RFdiffusion3 — это модель Foundry. Вы можете ознакомиться с его функционалом и другими моделями Foundry здесь: https://github.com/RosettaCommons/fou... Как установить RFdiffusion3: Он должен быть выпущен до выхода этого видео (как письменный, так и видеоурок) Документация RFdiffusion3: https://rosettacommons.github.io/foun... Другие видеоуроки: Установка RFD3:    • RFdiffusion3 installation with Foundry   RFD3 для среднего уровня:    • RFdiffusion3 installation with Foundry   Узнайте больше о миссии Rosetta Commons и поддерживаемом программном обеспечении: https://rosettacommons.org Миниатюра: MolecularNodes: https://bradyajohnston.github.io/Mole...