15 идей для биоинформатических проектов

Узнайте больше о программах дистанционного обучения на степень магистра и доктора философии (MS и PhD) на кафедре микробиологии и клеточных наук Университета Флориды: https://microbiologyonline.ifas.ufl.e... 15 идей для биоинформатических проектов: 00:26 Проект 1: Воспроизведение рисунков с дополнительными данными 01:13 Проект 2: Воспроизведение рисунков ChIP-seq из статьи 01:35 Проект 3: Воспроизведение результатов РНК-секвенирования из статьи 02:03 Проект 4: Сравнение bedtools и mosdeep для расчета покрытия 02:51 Проект 5: Влияние субвыборки на распространенность метагеномики 03:46 Проект 6: Влияние субвыборки на точность определения вариантов 04:20 Проект 7: Влияет ли порядок чтения в FASTQ на последующие анализы? 04:57 Проект 8: Распараллеливание с использованием нескольких потоков или разделение данных и использование отдельных потоков для каждого файла 07:09 Проект 9: Создание веб-приложения для проведения биоинформатического анализа 07:40 Проект 10: Создание инструмента визуализации для биоинформатических форматов файлов 08:00 Проект 11: Создание инструмента отладки для сложных форматов файлов 08:24 Проект 12: Дополнение к существующему биоинформатическому инструменту 08:56 Проект 13: Написание (интерактивной?) статьи о статистических концепциях 09:13 Проект 14: Написание (интерактивной?) статьи о фильтрах Блума 09:37 Проект 15: Написание (интерактивной?) статьи о k-мерах и минимизаторах Другие идеи для проектов: Наше предыдущее видео «Идеи для биоинформатических проектов»:    • Bioinformatics project ideas   Гены и география Проект:    • Genes and geography -- a bioinformatics pr...   Проект РНК-секвенирования:    • RNA-seq tutorial with DESeq2: Differential...   Идеи для проектов из лаборатории Шатца: https://github.com/schatzlab/appliedg... Полезные ссылки: Найти статьи для воспроизведения в Nature Communications: https://www.nature.com/subjects/biolo... Запись в блоге Мин Тана о воспроизведении анализа ChIP-seq из статьи: https://crazyhottommy.github.io/repro... Учебное пособие Alexander Lab по воспроизведению результатов РНК-секвенирования из статьи: https://alexanderlabwhoi.github.io/BV... Библиотека Biowasm для запуска CLI-инструментов биоинформатики в браузере: https://biowasm.com Библиотека JavaScript для создания фильтров Блума в браузере: https://github.com/Callidon/bloom-fil...