Семинар по TASSEL, часть 2: LD, PCA, родство и GWAS

Центр селекции растений Университета Миннесоты проводит семинар по программному пакету TASSEL (Trait Analysis by aSSociation, Evolution and Linkage) от лаборатории Баклера в Корнельском университете. Обзор функций TASSEL, включая преобразование форматов файлов, импутацию генотипов (Часть 1) и анализ неравновесия сцепления (LD), анализ главных компонентов (PCA), родство и полногеномный ассоциативный анализ (GWAS) (Часть 2). Часть 1:    • TASSEL Workshop Part 1: overview, resource...   Установите TASSEL: https://www.maizegenetics.net/tassel Презентационные слайды и примеры данных, использованные во время семинара: https://github.com/SushanRu/TASSEL-wo... 0:36 Обзор примеров файлов 6:11 Сводка данных о фенотипах 8:23 Сводка данных о генотипах 13:22 Неравновесие сцепления (LD) 19:12 Анализ главных компонентов (PCA) 26:51 Родство 28:25 Полногеномное ассоциативное исследование (GWAS) Преподаватели: Доктор Сушан Ру, email: sru@umn.edu Доктор Прабин Баджгайн, email: bajga002@umn.edu Ставьте лайки и подписывайтесь на Центр селекции растений Подробнее:   / umnplantbreed     / plant-breeding-center-university-of-minnesota   Последние новости и информация о наших возможностях сотрудничества и образования в области селекции растений: https://plantbreed.umn.edu/