ImageJ 101 для каждого доктора наук с использованием графических данных!
PhDCoffeeTime
0:00 / 0:00
ImageJ 101 для каждого доктора наук с использованием графических данных!
71 137 просмотров · 6 лет назад
PhDCoffeeTime
22,8 тыс. подписчиков
71 137 просмотров · 6 лет назад
Что мне хотелось бы узнать об ImageJ (Функции макросов и пакетной обработки) #imagej (длинное название)
Картинка стоит тысячи слов, и когда вы получаете изображение для своего исследования, обязательно рассматривайте каждый пиксель как потенциальный источник данных!
Моя любимая программа, безусловно, ImageJ, потому что она бесплатна, имеет открытый исходный код и предлагает множество мощных приложений для преобразования научных изображений в готовые к публикации данные и красивые графики.
В честь моей долгой дружбы с ImageJ, лучшим другом во времена аспирантуры и постдокторантуры, я снял это видео и надеюсь, что оно передаст её следующему поколению учёных.
В этом видео мы рассмотрим распространённые применения ImageJ:
🧫Подсчёт клеток
📐Измерение длины и площади
🌡Интенсивность гелевой полосы
🔬Количественная оценка флуоресценции
🗿Расчёт объёма в 3D
🦠Скорость миграции клеток
Недавно я также открыл для себя инструмент автоматизации анализа изображений и очень пожалел, что не узнал об этом раньше!
Временные метки:
Начало 0:00
История Image J и её применение 1:34
Основы анализа длины и площади 4:10
Основы измерения интенсивности 7:45
Вычисление объёма в 3D 9:00
Макроскрипты ImageJ FIJI и скрипт пакетной обработки 10:21
Скачать ImageJ:
https://imagej.net/Fiji/Downloads
Учебные пособия и примеры:
https://imagej.nih.gov/ij/docs/exampl...
Также смотрите:
Простой способ организации компьютерных файлов | Советы для исследователей!
• How to Keep Track of Everything in Your Ph...
Как обрабатывать данные и суммировать статистику
• How to Process Data Without Getting Lost
Как создать географическую тепловую карту в Excel | Визуализация случаев заболевания коронавирусом в мире
• Visualizing Geographical Map on Excel - CO...
***********************************
Обо мне:
Я биолог, заканчиваю шестой год постдокторантской программы. Я вырос в Гонконге, работал в США, а сейчас живу во Франции и ищу свою следующую работу в частном секторе науки.
Рекрутеры, пожалуйста, свяжитесь со мной по вопросам трудоустройства: / verabschan
Прежде чем завершить свою работу постдокторанта, я очень надеюсь снять видео на YouTube, ориентированные на молодое научное сообщество. Вот, в принципе, чем я мог бы поделиться, если бы вы нашли меня постдоком в своей лаборатории. Надеюсь, мои личные советы придадут позитивный настрой, поддержку и вдохновение тем, кто находится на пути академических исследований.
*************************************
Видеоблоги:
Как я приехал во Францию + Советы по долгосрочной визе + Euraxess
• Long-Stay Visa Tips When I Arrived in Fran...
Как я справляюсь с непредсказуемым будущим (и продуктивно работаю из дома)
• How to Work Better From Home | First Lockd...