Геномный браузер UCSC: Браузер коронавируса SARS-CoV-2

В браузере генома UCSC создан ресурс данных для вирусологов, позволяющий просматривать геном SARS-CoV-2. Выравнивание генов и белков отображается в координатах, а варианты вирусов, выделенных от людей со всего мира, визуализируются. Также показаны вирусы других животных, включая летучих мышей и панголинов. В этом видео описывается работа браузера для вирусологов и других специалистов, не знакомых с ним, с акцентом на функции отображения и полезные наборы данных. Транскрипт: https://genome.ucsc.edu/vids/transcri... [ 0:52] Портал Covid19 [ 1:27] Парадигма браузера [ 2:09] Названия вирусных сборок [ 2:45] Наборы данных SARS-CoV-2 [ 3:02] Треки UniProt [ 4:11] Страницы с подробной информацией об аннотациях [ 4:29] Настройка параметров отображения треков [ 4:43] Трек NCBI Genes [ 5:27] Праймеры RT-PCR [ 7:29] Коронавирусы, поражающие позвоночных [10:51] Консервативность PhastCons [11:15] Варианты и клады Nextstrain [14:15] T-реактивные эпитопы [15:14] BLAT и Short Match [17:33] Данные, полученные методом краудсорсинга