Анализ обогащения наборов генов (+ руководство по R)
LiquidBrain
0:00 / 0:00
Анализ обогащения наборов генов (+ руководство по R)
59 295 просмотров · 5 л. назад
LiquidBrain
24,6 тыс. подписчиков
59 295 просмотров · 5 л. назад
Анализ обогащения очень распространен в омиксных исследованиях. Знаете ли вы, что при получении одного и того же результата в анализе дифференциальной экспрессии мы можем получить два разных типа результатов обогащения? Это видео расскажет вам, как и почему их проводить.
Извините за плохой фоновый звук
Полезные ссылки:
1. Учебное пособие по ClusterProfiler
http://yulab-smu.top/clusterProfiler-...
2. Учебный центр Harvard Chan Bioinformatics Core (HBC)
https://hbctraining.github.io/DGE_wor...
3. Оригинальная статья GSEA
Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., ... & Mesirov, J. P. (2005). Анализ обогащения наборов генов: подход, основанный на знаниях, для интерпретации общегеномных профилей экспрессии. Труды Национальной академии наук, 102(43), 15545-15550.
Свяжитесь со мной:
Электронная почта: liquidbrain.r@gmail.com
Github: https://github.com/Lindseynicer
Twitter: / lianfoong
Дополнительная информация:
https://bit.ly/LiancheeFoong
Электронная почта: liquidbrain.r@gmail.com
Веб-сайт: https://www.liquidbrain.org/videos
Patreon: / liquidbrain