Перейти к содержимому

Анализ обогащения наборов генов (+ руководство по R)

LiquidBrain

0:00 / 0:00

Анализ обогащения наборов генов (+ руководство по R)

59 295 просмотров · 5 л. назад
LiquidBrain
24,6 тыс. подписчиков
59 295 просмотров · 5 л. назад
Анализ обогащения очень распространен в омиксных исследованиях. Знаете ли вы, что при получении одного и того же результата в анализе дифференциальной экспрессии мы можем получить два разных типа результатов обогащения? Это видео расскажет вам, как и почему их проводить. Извините за плохой фоновый звук Полезные ссылки: 1. Учебное пособие по ClusterProfiler http://yulab-smu.top/clusterProfiler-... 2. Учебный центр Harvard Chan Bioinformatics Core (HBC) https://hbctraining.github.io/DGE_wor... 3. Оригинальная статья GSEA Subramanian, A., Tamayo, P., Mootha, V. K., Mukherjee, S., Ebert, B. L., Gillette, M. A., ... & Mesirov, J. P. (2005). Анализ обогащения наборов генов: подход, основанный на знаниях, для интерпретации общегеномных профилей экспрессии. Труды Национальной академии наук, 102(43), 15545-15550. Свяжитесь со мной: Электронная почта: liquidbrain.r@gmail.com Github: https://github.com/Lindseynicer Twitter:   / lianfoong   Дополнительная информация: https://bit.ly/LiancheeFoong Электронная почта: liquidbrain.r@gmail.com Веб-сайт: https://www.liquidbrain.org/videos Patreon:   / liquidbrain