Руководство для начинающих по анализу экспрессии генов — Часть 2 | GoAnnotations | Cytoscape | En...

Примечание: Это видео было повторно опубликовано после улучшения качества звука для более комфортного просмотра. Спасибо за ваше терпение и поддержку! Добро пожаловать в мой урок по анализу экспрессии генов! В этом видео я шаг за шагом покажу вам, как анализировать данные экспрессии генов с помощью GEO2R. Я продемонстрирую, как работать с файлом .csv, фильтровать дифференциально экспрессируемые гены (DEGs) и выполнять функциональную аннотацию с помощью мощных инструментов, таких как Enrichr и ClueGO в Cytoscape. Независимо от того, являетесь ли вы новичком или хотите усовершенствовать свои навыки в области биоинформатики, этот урок поможет вам уверенно интерпретировать данные экспрессии генов и получать биологические выводы. Рассматриваемые темы: Фильтрация дифференциально экспрессирующихся генов (DEGs) на основе логарифмического изменения экспрессии и P-значений Выполнение аннотаций онтологии генов (GO) (биологические процессы, молекулярные функции и клеточные компоненты) Анализ обогащения сигнальных путей Использование Enrichr для быстрой веб-аннотации Визуализация сетей GO и сигнальных путей с использованием ClueGO и CluePedia в Cytoscape Упомянутые инструменты и ссылки: GEO2R: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/ Enrichr: https://maayanlab.cloud/Enrichr/enrich Cytoscape: https://cytoscape.org/ ClueGO: https://apps.cytoscape.org/apps/cluego CluePedia: https://apps.cytoscape.org/apps/cluep... Теги: Биоинформатика, Белок, Экспрессия генов, ДНК, РНК